Ich hatte sie im Launcher aktiviert. Das Problem liegt wahrscheinlich an meiner Graka (Nvidia GTX 850M).
Ich hab jetzt das Problem "gelöst":
In der SkyrimPrefs.ini Sektion [Imagespace] bDoDepthOfField=0 setzen, das deaktiviert die Unterwassersicht komplett, ist zwar etwas unbefriedigend, aber immerhin kann ich jetzt auch Unterwasser was sehen.