Du siehst die Mod´s auf der linken Seite alle aufgereiht. Markiere die Mod, die in der Reihenfolge verschoben werden soll und klicke dann mit der Maus unten in der Leiste auf Move up oder Move down. Je nachdem was du erreichen willst.
Beachte dabei, das der Omm es nicht zuläßt, das eine esp vor einer esm geladen wird. Ganz im Gegensatz zum Mmm (Morrowind Modmanager)