FNIS über Mod Organizer 2

Hey Leute und hallo erstmal,
also ich bin schon seit Ewigkeiten eig. dabei Skyrim zu modden und dementsprechend zu spielen, seit ich auf dem mod organizer 2 umgestiegen bin, hab ich aber so meine Probleme mit dem FNIS Generator, also wo man seine Animationen laden kann.
Folgendes Problem:
Es gibt ja diverse Erklärungsvideos, wie FNIS jetzt genau mit dem MO2 benutzt werden muss. Ich habe die Erklärungen relativ genau befolgt und dementsprechend FNIS über den MO2 installiert. Mein Problem ist, dass die FNIS Dateien und Programme nicht im Spielverzeichnis auftauchen, wo sie bei einer manuellen Installation von FNIS (die auf der Modseite angegeben ist) eigentlich hingehören, sprich unter [...]\Skyrim Special Edition\Data\tools gibt es schlicht und ergreifend nichts. Anders siehts aus im Mod-Ordner meines MO2, dort gibt es z.b. folgendes sehr wohl:

[...]\AppData\Local\ModOrganizer\First Instance\mods\FNIS SE\tools\GenerateFNIS_for_Users usw.
Die Sache ist, wenn ich jetzt FNIS über die eingebundene exe-Datei dort local oder aus dem MO2 aus starte und wie immer die Animationen "lade", wird alles ganz normal angezeigt, dass er so und so viel geladen hat. Nur ingame funktioniert halt nichts davon - irgendwie glaub ich, ist da was mit der Ordnerstruktur nicht in Ordnung, bzw. kann FNIS vom MO2-Mod-Ordner aus (der liegt bei mir ja bei AppData) nicht auf den Spieleordner zugreifen.

Hat da jemand ne Idee? Bin mir sicher, dass es nur irgendwo an dieser Ordnerstruktur liegt und an nichts anderem.
Müsste ich möglicherweise meinen Mod-organizer wo anders hinverschieben? Ich hatte halt irgendwo gelesen, dass gewisse Dateien von dem im AppData Ordner bleiben müssen, daher bin ich mir da echt nicht sicher.

Wäre super, wenn wir jemand helfen kann!!

Danke erstmal für die Antworten!
Ich hatte den Teil mit dem Output FNIS zwar schon mal gemacht, nachdem ich es jetzt nochmal mit der Anleitung von vorn gemacht hab, funktioniert das meiste aber wie gewollt, also schien da wohl der Fehler zu sein. Vielleicht war der Output-Ordner vorher nicht leer oder so...
Hab zwar immer noch paar Animationen, die ingame nicht auftauchen, aber da muss ich mal schauen, wie ich die Warnungen von FNIS fixen kann.

edit:
die Warnung bei der Aktualisierung der FNIS Behavior zeigt mir übrigens genau das an, was ich schon am Anfang vermutet hatte:
>>Warnung: Erwarteter Generator-Pfad: C:\Program Files (x86)\steam\steamapps\common\Skyrim Special Edition\data\tools\GenerateFNIS_for_Users not fond <<

ich habe Steam halt nicht mehr im Program Files (x86) Ordner, hab FNIS und den MO2 aber eig. nach der Aktion neu installiert, daher dürfte das doch kein Problem sein, oder?